Røntgenundersøkelser bidrar med en vesentlig del av den eksponeringen for ioniserende stråling som befolkningen utsettes for. MR bruker ikke røntgenstråler, og metoden ansees å være fri for bivirkninger og eksponeringsfare. Dette er belyst i et EU-direktiv (document 397L0043) hvor det legges klare føringer for å gå over til MR fremfor å bruke CT eller andre typer røntgenundersøkelser når MR kan erstatte undersøkelser med ioniserende stråler.

Slik betalingen er for MR-undersøkelser ved private institutter, foreligger det i dag et økonomisk incitament for de private instituttene til å gjennomføre undersøkelser som belaster pasientene med ioniserende stråler fremfor å gjøre MR-undersøkelser.